Vector Contamination List

At PlantGDB, efforts are undertaken to identify and remove all contaminant DNA so that a clean dataset is made available to researchers. Here, we use the Vmatch program (with options -l 50 -identity 90) to screen EST sequences against UniVec for vector contaminations as well as against E. coli genomes for bacterial sequences contaminations. The table lists the individual contaminated sequence. (Return to Vector Contamination menu)



Skip to page: 1 2 3 4
Sequence ID Organism Sequence Type Contamination Type
220899961Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220899962Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220899965Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220899966Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220899967Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220899968Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220899969Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220899970Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220899971Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220899972Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220899974Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220899975Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220899977Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220899979Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220899980Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220899981Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220899984Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220899985Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220899987Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220899988Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220899990Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220899991Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220899992Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220899994Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220899995Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220899996Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220899997Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220899998Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900001Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900002Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900004Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900005Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900006Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900008Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900009Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900010Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900011Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900012Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900013Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900015Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900018Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900019Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900022Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900023Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900024Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900028Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900029Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900030Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900035Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900036Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900037Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900041Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900048Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900049Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900050Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900051Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900052Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900053Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900054Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900056Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900057Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900058Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900059Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900060Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900061Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900062Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900064Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900065Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900066Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900069Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900071Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900072Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900073Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900074Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900075Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900076Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900077Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900078Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900079Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900080Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900081Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900083Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900085Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900087Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900088Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900089Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900090Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900092Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900094Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900095Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900096Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900097Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900099Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900100Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900101Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900103Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900104Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900105Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900106Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector
220900108Camellia_sinensis_var__sinensisESTVector

Loading Help Page...Thanks for your patience!

Loading Video...Thanks for your patience!

Loading Image...Thanks for your patience!