Vector Contamination List

At PlantGDB, efforts are undertaken to identify and remove all contaminant DNA so that a clean dataset is made available to researchers. Here, we use the Vmatch program (with options -l 50 -identity 90) to screen EST sequences against UniVec for vector contaminations as well as against E. coli genomes for bacterial sequences contaminations. The table lists the individual contaminated sequence. (Return to Vector Contamination menu)



Skip to page: 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 21 28
Sequence ID Organism Sequence Type Contamination Type
283049723Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283049726Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283049729Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283049744Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283049748Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283049770Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283049771Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283049807Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283049837Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283049843Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283049900Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580289Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580318Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580365Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580385Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580386Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580601Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580602Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580387Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580388Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580389Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580390Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580391Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580392Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580394Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580395Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580396Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580397Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580398Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580399Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580400Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580402Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580403Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580405Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580406Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580407Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580408Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580409Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580410Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580411Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580412Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580413Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580414Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580415Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580416Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580417Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580419Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580421Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580423Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580425Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580426Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580430Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580431Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580432Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580433Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580434Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580435Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580436Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580437Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580438Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580439Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580441Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580442Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580444Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580445Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580446Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580447Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580448Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580449Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580450Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580451Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580452Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580453Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580454Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580455Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580456Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580457Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580458Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580459Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580460Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580461Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580462Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580463Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580464Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580466Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580467Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580468Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580469Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580471Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580472Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580473Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580474Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580476Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580477Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580478Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580479Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580480Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580482Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580484Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector
283580487Camellia_sinensis_var__assamicaESTVector

Loading Help Page...Thanks for your patience!

Loading Video...Thanks for your patience!

Loading Image...Thanks for your patience!