Vector Contamination List
At PlantGDB, efforts are undertaken to identify and remove all contaminant DNA so that a clean dataset is made available to researchers. Here, we use the Vmatch program (with options -l 50 -identity 90) to screen EST sequences against UniVec for vector contaminations as well as against E. coli genomes for bacterial sequences contaminations. The table lists the individual contaminated sequence. (Return to Vector Contamination menu)
| Sequence ID | Organism | Sequence Type | Contamination Type |
|---|---|---|---|
| 260196362 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196370 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196373 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196378 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196383 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196388 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196081 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196093 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196094 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196098 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196099 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196103 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196116 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196127 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196140 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196141 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196142 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196148 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196152 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196173 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196176 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196179 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196183 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196184 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196185 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196189 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196194 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196198 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196202 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196207 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196218 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196219 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196220 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196226 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196228 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196234 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196240 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196243 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196245 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196260 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196269 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196272 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196277 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196291 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196304 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196305 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196310 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196313 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196318 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196321 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196322 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196326 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196332 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196339 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260196342 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680418 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680359 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680376 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680386 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680404 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680427 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680431 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680437 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680446 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680449 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680460 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680481 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680495 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680506 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680508 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680513 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680516 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680525 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680526 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680528 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680529 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680531 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680537 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680556 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680562 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680564 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680580 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680589 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680593 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680597 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680606 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680611 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680613 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680620 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680621 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680623 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680631 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680634 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680635 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680639 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680652 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680654 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680656 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680664 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |
| 260680665 | Bienertia_sinuspersici | EST | Vector |