Vector Contamination List

At PlantGDB, efforts are undertaken to identify and remove all contaminant DNA so that a clean dataset is made available to researchers. Here, we use the Vmatch program (with options -l 50 -identity 90) to screen EST sequences against UniVec for vector contaminations as well as against E. coli genomes for bacterial sequences contaminations. The table lists the individual contaminated sequence. (Return to Vector Contamination menu)



Skip to page: 1 2 3 4 5 6 7 8
Sequence ID Organism Sequence Type Contamination Type
82759188Agrostis_capillarisESTVector
82759202Agrostis_capillarisESTVector
82759206Agrostis_capillarisESTVector
82759218Agrostis_capillarisESTVector
82759219Agrostis_capillarisESTVector
82759220Agrostis_capillarisESTVector
82759231Agrostis_capillarisESTVector
82759240Agrostis_capillarisESTVector
82759259Agrostis_capillarisESTVector
82759261Agrostis_capillarisESTVector
82759269Agrostis_capillarisESTVector
82759274Agrostis_capillarisESTVector
82759286Agrostis_capillarisESTVector
82759311Agrostis_capillarisESTVector
82759346Agrostis_capillarisESTVector
82759356Agrostis_capillarisESTVector
82759359Agrostis_capillarisESTVector
82759367Agrostis_capillarisESTVector
82759375Agrostis_capillarisESTVector
82759380Agrostis_capillarisESTVector
82759382Agrostis_capillarisESTVector
82759384Agrostis_capillarisESTVector
82759388Agrostis_capillarisESTVector
82759437Agrostis_capillarisESTVector
82759447Agrostis_capillarisESTVector
82759457Agrostis_capillarisESTVector
82759462Agrostis_capillarisESTVector
82759465Agrostis_capillarisESTVector
82759468Agrostis_capillarisESTVector
82759554Agrostis_capillarisESTVector
82759564Agrostis_capillarisESTVector
82759584Agrostis_capillarisESTVector
82759597Agrostis_capillarisESTVector
82759599Agrostis_capillarisESTVector
82759603Agrostis_capillarisESTVector
82759615Agrostis_capillarisESTVector
82759643Agrostis_capillarisESTVector
82759660Agrostis_capillarisESTVector
82759666Agrostis_capillarisESTVector
82759676Agrostis_capillarisESTVector
82759690Agrostis_capillarisESTVector
82759727Agrostis_capillarisESTVector
82759731Agrostis_capillarisESTVector
82759733Agrostis_capillarisESTVector
82759735Agrostis_capillarisESTVector
82759739Agrostis_capillarisESTVector
82759758Agrostis_capillarisESTVector
82759761Agrostis_capillarisESTVector
82759775Agrostis_capillarisESTVector
82759782Agrostis_capillarisESTVector
82759784Agrostis_capillarisESTVector
82759822Agrostis_capillarisESTVector
82759829Agrostis_capillarisESTVector
82759862Agrostis_capillarisESTVector
82759897Agrostis_capillarisESTVector
82759900Agrostis_capillarisESTVector
82759902Agrostis_capillarisESTVector
82759908Agrostis_capillarisESTVector
82759910Agrostis_capillarisESTVector
82759936Agrostis_capillarisESTVector
82759945Agrostis_capillarisESTVector
82759960Agrostis_capillarisESTVector
82759969Agrostis_capillarisESTVector
82760008Agrostis_capillarisESTVector
82760030Agrostis_capillarisESTVector
82760044Agrostis_capillarisESTVector
82760048Agrostis_capillarisESTVector
82760059Agrostis_capillarisESTVector
82760071Agrostis_capillarisESTVector
82760084Agrostis_capillarisESTVector
82760085Agrostis_capillarisESTVector
82760093Agrostis_capillarisESTVector
82760095Agrostis_capillarisESTVector
82760104Agrostis_capillarisESTVector
82760129Agrostis_capillarisESTVector
82760139Agrostis_capillarisESTVector
82760142Agrostis_capillarisESTVector
82760143Agrostis_capillarisESTVector
82760149Agrostis_capillarisESTVector
82760162Agrostis_capillarisESTVector
82760163Agrostis_capillarisESTVector
82760166Agrostis_capillarisESTVector
82760170Agrostis_capillarisESTVector
82760192Agrostis_capillarisESTVector
82760215Agrostis_capillarisESTVector
82760216Agrostis_capillarisESTVector
82760221Agrostis_capillarisESTVector
82760223Agrostis_capillarisESTVector
82760231Agrostis_capillarisESTVector
82760232Agrostis_capillarisESTVector
82760233Agrostis_capillarisESTVector
82760234Agrostis_capillarisESTVector
82760243Agrostis_capillarisESTVector
82760251Agrostis_capillarisESTVector
82760254Agrostis_capillarisESTVector
82760262Agrostis_capillarisESTVector
82760274Agrostis_capillarisESTVector
82760275Agrostis_capillarisESTVector
82760276Agrostis_capillarisESTVector
82760287Agrostis_capillarisESTVector

Loading Help Page...Thanks for your patience!

Loading Video...Thanks for your patience!

Loading Image...Thanks for your patience!