Vector Contamination List
At PlantGDB, efforts are undertaken to identify and remove all contaminant DNA so that a clean dataset is made available to researchers. Here, we use the Vmatch program (with options -l 50 -identity 90) to screen EST sequences against UniVec for vector contaminations as well as against E. coli genomes for bacterial sequences contaminations. The table lists the individual contaminated sequence. (Return to Vector Contamination menu)
| Sequence ID | Organism | Sequence Type | Contamination Type |
|---|---|---|---|
| 195965465 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965468 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965469 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965470 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965471 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965472 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965473 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965474 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965475 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965476 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965477 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965478 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965481 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965482 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965483 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965484 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965485 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965486 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965488 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965489 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965490 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965491 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965492 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965493 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965494 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965496 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965497 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965498 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965500 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965501 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965502 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965503 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965504 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965505 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965506 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965507 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965509 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965510 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965512 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965513 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965514 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965515 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965517 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965518 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965519 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965520 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965522 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965523 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965524 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965525 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965527 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965528 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965529 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965531 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965532 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965534 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965535 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965536 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965537 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965538 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965539 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965541 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965542 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965543 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965545 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965546 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965547 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965548 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965549 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965552 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965555 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965556 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965058 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965060 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965061 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965062 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965063 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965064 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965066 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965067 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965068 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965070 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965087 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965093 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965097 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965098 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965113 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965114 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965116 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965119 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965120 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965121 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965123 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965124 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965125 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965141 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965142 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965144 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965145 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |
| 195965146 | Adonis_aestivalis | EST | Vector |